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生命科技核心工具缔造者
高通量测序技术助力
建库技术的研究与应用
CycloneSEQ™ 测序技术是华大的纳米孔测序技术,在测序过程中,基于该平台进行测序时,DNA 文库在马达蛋白的引导下以单链形式依次通过嵌合在膜上的纳米孔道蛋白。当不同的碱基穿过纳米孔时,会引发纳米孔中离子电流的变化。这些变化的电信号被通道传感器检测,再通过专用碱基识别算法进行解析,从而实现实时且准确地获取DNA链上碱基的排列顺序。
CycloneSEQ™ 测序技术与DNBSEQ™ 测序技术在测序长度和测序精度方面可以完美配合,在基因组组装、基因组结构变异检测和转录组研究等应用场景中,可实现更完整、更精准的分析:
● 基因组组装:短读长测序技术提供高覆盖度和准确性,长读长测序提供连续长序列段,两者结合可以组装出高质量的基因组序列。
● 基因组结构变异检测:短读长测序提供准确的SNP和INDEL检测,长读长测序直接检测复杂结构变异,可以获得更准确的基因组信息。
● 转录组研究:短读长测序进行定量表达分析,长读长测序获得全长转录本序列,获得更丰富的转录本信息。
核心蛋白:
在从马里亚纳海沟等极端环境中收集样本的5亿多条深海宏基因组数据库中,分析发现深海中基因操作相关蛋白丰度高,具有更多结构多样性。其中有一种高鲁棒性的核酸操纵蛋白,它的核心功能区域结构显著不同于大多数已知的马达蛋白结构,解旋能力更强,并且它是热液区来源,热稳定性高;另一种是由同源多聚体自组装形成的结构致密的孔蛋白,蛋白结构刚性强,测序噪声小质量高,孔径小。经过蛋白工程的设计改造,马达蛋白更加具有测序速度快,稳定性强,持久续测的特点,孔道蛋白具有强捕获,高稳定,持久续测,信噪比高的特点,这些蛋白构成了CycloneSEQ™ 的核心蛋白基础。
单芯片的纳米孔传感器采用高密度阵列式排布。传感器微腔直径及间距被精细优化,膜孔最佳适配,实现超低测序噪声。微腔体积拓展,可实现超长测序时长。生物微机电系统(BioMEMS)与专用集成电路(ASIC)一体化集成,具备皮安级电流精准检测能力,实时、稳定读取核酸序列信息。
结合ASR(自动语音识别)领域 SOTA 方案的测序解码算法,通过海量数据训练的深度神经网络,在所有可能的组合中找到最优序列并精准解码,自主开发出的 basecall 算法模型。该算法模型基于海量数据,大规模分布式训练,模型准确率高达97%,且可以满足多张芯片实时测序解码,性能强劲。
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