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你问我答 | 基因测序仪DNBSEQ-E25

发布时间:2024.12.27

作者:华大智造

浏览量:46

《你问我答》栏目搜集了华大智造客户的常问问题,并为大家整理出了不同产品的FAQ,后续将陆续发布,帮助您更好地使用我们的产品。

更多DNBSEQ-E25相关问题,欢迎前往智能客服(点击网页右侧客服图标即可进入)提问。


Q1:DNBSEQ-E25有什么独特亮点?

DNBSEQ-E25,小巧、简单、快捷,使用0门槛:

◾小巧:0.1平方米;无需洁净间;无特殊环境要求。

◾简单:开箱即用;无需光路调校;易维护。

◾快捷:10分钟准备时间;5~8小时测序。


Q2:DNBSEQ-E25占地面积?

DNBSEQ-E25仪器占桌面积仅0.1㎡。


Q3:DNBSEQ-E25适配哪些应用?

主推应用包括病原快检、小型全基因组测序、靶向测序、教育培训等方向。


Q4:DNBSEQ-E25的最大产能?

DNBSEQ-E25最大产能为7.5GB。


Q5:DNBSEQ-E25最快输出下机数据的时间?

DNBSEQ-E25最快5小时左右就可以输出下机数据(SE100测序读长),对特殊样本的紧急测序需求能够给予即时响应,适用于突发公共卫生事件处理等应用场景。


Q6:DNBSEQ-E25的最小读长和最大读长?

DNBSEQ-E25最小读长为SE35,最大读长为PE150。您也可以在仪器操作界面自定义读长,如SE75、PE100等。


Q7:DNBSEQ-E25在最大读长以外是否还支持自定义读长?

支持,操作者可以在仪器界面输入所需读长,例如可使用SE100耗材运行SE35、SE50、SE75等读长的测序,亦可使用PE150耗材运行PE100测序,或双端不等长的测序应用,如Read1: 60bp+Read2: 30bp。


Q8:DNBSEQ-E25有几种机型?

DNBSEQ-E25有2种配置,包括:标准机型(DNBSEQ-E25RS)可高效处理主机采集的原始数据,输出标准格式的FASTQ数据;扩展机型(DNBSEQ-E25ARS)在标准机型的基础上,可以集成生信流程,实现测序与分析合二为一。


Q9:DNBSEQ-E25测序仪适配华大智造的实验室管理系统吗?

与华大智造其他测序仪产品类似,DNBSEQ-E25测序仪可以通过Zlims系统,实现测序数据自动传输。亦可通过Zlims系统调度生信分析。


Q10:DNBSEQ-E25在生化原理上与其他DNBSEQ平台有何异同?

DNBSEQ-E25在生化原理上与其他DNBSEQ平台的异同如下:

(1)相同:DNBSEQ-E25采用华大智造独有的 DNBSEQ™测序技术,包括滚环扩增生成 DNA 纳米球(DNB),规则阵列载片和 cPAS 联合探针锚定聚合测序法,具有测序准确度高,重复序列率低,标签跳跃少的特点。

(2)不同:

①流体:DNBSEQ-E25采用微流控技术,将传统测序仪中的液路流道集成在一次性芯片中,节省试剂消耗量,废液测试后随耗材抛弃,操作简单,仪器内部无液体接触,无需日常清洗与维护,大幅提高测序仪的可靠度。

②检测:DNBSEQ-E25采用CMOS传感器直接从DNB阵列同时读取DNA序列信息,无需依赖传统光学系统,大幅缩短测序时间。

③化学:DNBSEQ-E25采用改良版的cPAS联合探针锚定聚合测序法,加速生化反应速率,进一步缩短测序时长。


Q11:DNBSEQ-E25试剂盒是否支持单、双Barcode测序?

都支持,所有型号的测序耗材都已预装Barcode测序(或双Barcode测序,至多20bp)所需条形码引物、测序试剂等,无需额外补充任何试剂。这也是SE100、PE150测序耗材的规格为120Cycles,320Cycles的原因。


Q12:DNBSEQ-E25参数内时间均不包含标签测序时间,如果测Barcode,额外需要多少时间?

取决于标签读长(8bp或10bp),单Barcode测序将会需要额外的35-40分钟,双Barcode测序将会需要额外的60-70分钟。


Q13:DNBSEQ-E25测序试剂盒在制备DNB流程上与其他平台有何异同?

DNBSEQ-E25默认适配一步法制备DNB,由线性文库(dsDNA,如PCR产物、连接产物等)直接制备DNB,相较于单链环化再制备DNB的两步法,建库及制备DNB时间可得到进一步压缩。如此设计主要考虑到E序列主打快速测序,需要尽可能压缩建库、测序流程时间,同时也考虑DNBelab-D4数字化样本制备系统与DNBSEQ-E25测序仪的适配问题。


Q14:如何维护DNBSEQ-E25?

DNBSEQ-E25测序仪由于采用微流控测序载片与集成式试剂盒的设计,常态化运行情况下无需进行额外水洗等操作。我们建议您至少以每月一次的频率,在E25开机状态下,用棉球蘸75%酒精擦拭E25载片托架,并确保该载片托架上无液体及结晶残留即可。


Q15:如果我需要打包DNBSEQ-E25运输到另一个实验场地,要如何操作?

在打包之前,请在仪器界面选择计算模块关机关闭计算模块,再将运输专用载片置于载台,在仪器界面选择“打包关机”,仪器将会自动运行,复位至打包位置。当测序仪主机界面出现可以关闭电源界面时,关闭测序仪主机电源。随后将测序仪主机、计算模块、电源适配器、电源线等依次打包即可。

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